Uprava za neizravno oporezivanje je u 2013. godini prikupila rekrodne prihode od uspostave ove institucije. Prikupljeni prihodi od indirektnih poreza, a to su PDV, akcize, carine i putarina iznosili su 5 milijardi i 882 milijuna KM, što je za 10 milijuna KM više u odnosu na prihode prikupljene u 2012. godini i za 2,1 milijun KM više u odnosu na planirane prihode u 2013. godini.
Uprava je tijekom 2013. godine gospodarstvu vratila 997 milijuna KM povrata PDV-a, tako da su neto prihodi raspoređeni korisnicima, a to su država, entiteti i Distrikt Brčko, iznosili u 2013. godini 4 milijarde i 885 milijuna KM.
Prihodi od neizravnih poreza prikupljeni od 2005. godine, kada je počela sa radom Uprava za neizravno oporezivanje, pa do 2013. godine iznosili su više od 46 milijardi KM.