U svom planu za 2016. godinu, koji je Federalni zavod za agropedologiju dostavio na razmatranje Vladi FBiH, kao strateški cilj istaknuto je očuvanje, upotreba i zaštita poljoprivrednog zemljišta. Kao prioritet naglašeno je da će Federalni zavod za agropedologiju u 2016. godini realizirati poslove proizišle iz zakonom utvrđene nadležnosti i usvojenih strategija, u cilju povećanja poljoprivredne proizvodnje, zaštite okoliša i racionalnijeg korištenja zemljišnih resursa, i to primjenom suvremenih metoda istraživanja.
Naglašeno je kako će se operativni ciljeve realizirati kroz izradu karata upotrebne vrijednosti zemljišta, programa, elaborata i mišljenja o uređenju zemljišta, kontrolu plodnosti tla, praćenje zagađenosti zemljišta te predlaganje mjera zaštite i sanacije svih oblika oštećenja poljoprivrednog zemljišta, rajonizaciju zemljišta i njegovo racionalno korištenje, monitoring (praćenje stanja i promjena na tlu i unutar njega), zemljišni informacijski sustav (ZIS) i vođenje evidencije o poljoprivrednom zemljištu, kao i izdavanje mišljenja, atesta i certifikata za korištenje poljoprivrednog zemljišta.
Zavod će sudjelovati i u izradi propisa koje pripremaju resorna ministarstva, dajući stručna mišljenja na propise, a koji se odnose na poljoprivredno zemljište te druge poslove i zadatke propisane Zakonom o poljoprivrednom zemljištu. Na realizaciju i ostvarenje postavljenih zadataka mogu utjecati određeni problemi, a koji mogu nastati zbog nepravodobnog izmirenja obveza po računima za energente, gorivo i repromaterijal. Osim toga, eventualne poteškoće mogu biti prouzročene stanjem miniranosti zemljišta, što ograničava rad na terenu.
Pri izradi godišnjeg plana rada Federalnog zavoda za agropedologiju za 2016. konzultirani su Federalno ministarstvo poljoprivrede, vodoprivrede i šumarstva, Federalno ministarstvo okoliša i turizma i Federalno ministarstvo prostornog uređenja, s kojima je uspostavljen sustav koordinacije preko nadležnih sektora. Osim navedenih federalnih ministarstava, Zavod se konzultirao i s drugim tijelima i upravama.
